قانون التحكيم الياباني اتفق مع القانون النموذجي بشأن مسألة الاختصاص؛ حيث يعطى الحق للأطراف فى إثارة الدفع بعدم اختصاص هيئة التحكيم أثناء سير الإجراءات، ويمكن لهيئة التحكيم أن تصدر حكمًا إما بصورة منفصلة عن الحكم النهائي إما في الحكم النهائي وفي الحالتين يمكن الطعن على أحكام هيئة التحكيم أمام المحكمة وتفصل فيها خلال ثلاثين يوما من استلام الإعلان.