إذا كان تحديد الأساس القانوني لعمل هيئة التحكيم لم يثر صعوبة حيث انتهينا إلى ازدواجية هذا الأساس ما بين اتفاقی و قانونی، فإن تحديد الطبيعة القانونية للتحكيم آثار الكثير من الجدل والنقاش - فمن نظر إلى جانب الاتفاق في التحكيم، اتجه إلى التقرير بالطبيعة التعاقدية أو الاتفاقية للتحكيم. ومن نظر إلى التحكيم على اعتبار أنه قضاء ينتهي بصدور حكم له حجيته، غلب الطبيعة القضائية للتحكيم.