يترك تشكيل محكمة هيئة التحكيم للمتنازعين المحتكمين الذين يكون لهم خيار تشكيلها من محكم واحد أو أكثر، حسب ما يتفقون عليه، فإذا اتفقوا على أكثر من محكم فيجب أن يكون عددهم وترا، وغالباً ما يكون ثلاثة محكمين. فإذا أخفق المتنازعون في الاتفاق على المحكمين خلال 45 يوماً بعد بداية التحكيم، قام مركز الويبو للتحكيم والوساطة بتحديد محكم واحد لتحكيم النزاع، إلا إذا استدعت ظروف النزاع عدداً أكثر فيحدّده المركز بثلاثة محكمين 25.
